Parmi les auteurs qui, au xvme siècle, rejettent l'existence de Dieu, Diderot occupe une position particulièrement importante, en ce que, bon connaisseur des sciences de son époque, il est l'un des premiers à se rendre compte que leur développement met en péril les preuves de l'existence de Dieu proposées depuis Descartes, dans le cadre de la science nouvelle. Il estime même que ce développement réfute le théisme. Ce faisant, l'Encyclopédiste promet plus qu'il ne peut prouver; mais par son argumentation, il est tantôt le témoin, tantôt l'inaugurateur d'une conception de la nature qui reste encore importante de nos jours.