Si la pensée de Philon est manifestement religieuse dans son inspiration, l'on n'est cependant pas fondé à la présenter, ainsi que le fait M. A. Maddalena, comme la systématisation philosophique du judaïsme, celui-ci étant censé contenu dans une formule unitaire. A la fin de l'ère ancienne et au début de l'ère chrétienne, le judaïsme nous apparaît en effet comme une religion très divisée sur les points les plus importants. D'autre part, la spéculation de Philon vise bien plutôt à la glose de l'Écriture sainte qu'au système. Les études philoniennes ne feront de progrès qu'après éclaircissement des liens qui rattachent le philosophe d'Alexandrie aux différents courants du judaïsme et singulièrement aux diverses écoles d'exégèse.